Tersangka teroris Zulkarnaen terlibat dalam sejumlah aksi terorisme. Ia terlibat dalam aksi bom kedutaan besar Filipina, kasus Poso Sulawesi Tengah, hingga Ambon, Maluku.
Dalam wawancara ekslusif, Zulkarnaen mengungkapkan sejumlah ormas membantu Jemaah Islamiyah dalam konflik Ambon.